MPI-IE Imaging Facility

Einheit für Mikroskopie

Die Einheit für Mikroskopie unterhält einen vielfältigen Bestand an modernsten Lichtmikroskopen und Software, mit denen Bilder von verschiedenen lebenden und unbeweglichen Objekten von aufgenommen und analysiert werden können, von hochauflösender Mikroskopie mit Verfahren, die in der Lage sind, unterhalb der Beugungsgrenze aufzulösen („Super-resolution“) bis hin zum Maßstab ganzer Organe. Die Einheit bietet darüber hinaus Schulungen und Beratung zur Probenvorbereitung, zum Betrieb der Mikroskope und zur Bildanalyse an und beteiligt sich an der Entwicklung von Methoden.

Warum Fluoreszenzmikroskopie?

Dank enormer Fortschritte bei Instrumenten, Software und molekularen„Werkzeugen“  wie genetisch kodierte Fluorophore, Ionensensoren und vieles Weiter hat sich die Fluoreszenzmikroskopie zu einer wichtigen, „eigenständigen“ Technologie in den modernen Biowissenschaften gemausert. Mit der Fluoreszenzmikroskopie kann fast jede Struktur von Interesse gezielt sichtbar gemacht werden. Darüberhinaus können Details, die kleiner sind als die von der konventionellen Optik gesetzten Grenzen, können durch kürzlich entwickelte „Super-Resolution“-Techniken sichtbar gemacht werden. In vielen Fällen sind dynamische, nicht invasive Beobachtungen von lebenden Objekten möglich und   quantitative Daten können extrahiert werden, einschließlich Informationen über Konzentration, spezifische Wechselwirkungen und Mobilität der interessierenden Moleküle.

Überblick über die Imaging-Einrichtungen

In der Einheit für Mikroskopie am MPI-IE stehen 10 hochmoderne Lichtmikroskope sowie umfangreiches Zubehör und Bildverarbeitungswerkzeuge zur Verfügung. Die Instrumente ermöglichen die Aufnahme von Bildern in einem Maßstab, der von „Superauflösung“ (<100 Nanometer) bis zu kompletten Organen (wenige Millimeter) reicht.

Wir unterstützen über 80 aktive Nutzer:innen des MPI-IE bei der Bildaufnahme und -analyse. Neben routinemäßigen Einzelschulungen zur Nutzung von Mikroskopen und Bildanalyseprogrammen vermittelt wir in Seminaren, Kursen und anderen Veranstaltungen umfangreiches Wissen über Mikroskopietechniken und relevante Anwendungen, z. B. in Form von theoretischen und praktischen Schulungen zur Benutzung der Lichtmikroskopie für Promovierende im Rahmen des IMPRS-Programms. Auch organisieren wir Vorführungen und Versuche mit neuer Mikroskopie-Software und -Hardware am MPI-IE.

Die Einheit für Mikroskopie steht in regem Austausch mit anderen Fachgesellschaften in Deutschland und Europa. Das MPI-IE ist Mitglied der Deutschen Gesellschaft für Bioimaging und Bildanalyse, dem Max Planck BioImaging Core Units Network und der Microscopy and Image Analysis Platform (MIAP), einem regionalen und trinationalen Netzwerk für die wissenschaftliche Infrastruktur von bildgebenden Einrichtungen in den Lebenswissenschaften. Die Mitgliedschaften in diesen Netzwerken geben den Nutzer:innen unserer Facility den Zugang zu einem breiten Arsenal an Spitzentechnologien, die vor Ort nicht verfügbar sind. Darüber hinaus ermöglichen diese Netzwerke den Austausch von Fachwissen zwischen den Imaging Core Facilities verschiedener Einrichtungen und Wissenschaftler:innen, die Methoden für die Mikroskopie und Bildanalyse entwickeln. Sie zudem Zugang zu Schulungen und Workshops von führenden Experten.

Weitere Informationen zu den Technologien und Services der Einheit für Mikroskopie finden Sie auf der englischsprachigen Webseite.


Ausgewählte Publikationen

Schmied C, Nelson MS, Avilov S, Bakker GJ, Bertocchi C, Bischof J, Boehm U, Brocher J, Carvalho MT, Chiritescu C, Christopher J, Cimini BA, Conde-Sousa E, Ebner M, Ecker R, Eliceiri K, Fernandez-Rodriguez J, Gaudreault N, Gelman L, Grunwald D, Gu T, Halidi N, Hammer M, Hartley M, Held M, Jug F, Kapoor V, Koksoy AA, Lacoste J, Le Dévédec S, Le Guyader S, Liu P, Martins GG, Mathur A, Miura K, Montero Llopis P, Nitschke R, North A, Parslow AC, Payne-Dwyer A, Plantard L, Ali R, Schroth-Diez B, Schütz L, Scott RT, Seitz A, Selchow O, Sharma VP, Spitaler M, Srinivasan S, Strambio-De-Castillia C, Taatjes D, Tischer C, Jambor HK (2024)
Community-developed checklists for publishing images and image analyses.
Nature Methods (2), 170-181.
Avilov SV (2021)
Navigating across multi-dimensional space of tissue clearing parameters.
Methods and Applications in Fluorescence 9(2):022001.
Sheikh BN, Guhathakurta S, Tsang TH, Schwabenland M, Renschler G, Herquel B, Bhardwaj V, Holz H, Stehle T, Bondareva O, Aizarani N, Mossad O, Kretz O, Reichardt W, Chatterjee A, Braun LJ, Thevenon J, Sartelet H, Blank T, Grün D, von Elverfeldt D, Huber TB, Vestweber D, Avilov S, Prinz M, Buescher JM and Akhtar A (2020)
Neural metabolic imbalance induced by MOF dysfunction triggers pericyte activation and breakdown of vasculature
Nature Cell Biology 22(7), 828-841.

Jevtic V, Kindle P, Avilov S (2018)

SYBR Gold dye enables preferential labelling of mitochondrial nucleoids and their time-lapse imaging by structured illumination microscopy.
PLoS ONE 13(9), e0203956. 
Avilov S, Aleksandrova N (2018)
Fluorescence protein complementation in microscopy: Applications beyond detecting bi-molecular interactions
Methods and Applications in Fluorescence 7(1), 012001.
Ferrando-May E, Hartmann H, Reymann J, Ansari N, Utz N, Fried HU, Kukat C, Peychl J, Liebig C, Terjung S, Laketa V, Sporbert A, Weidtkamp-Peters S, Schauss A, Zuschratter W, Avilov S; German BioImaging network (2016)
Advanced light microscopy core facilities: Balancing service, science and career
Microscopy Research & Technique 79(6), 463-79.
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